我院面向国家“健康中国”战略需求，紧扣生物医学工程领域前沿发展动向，秉承“医工融创、育才致远”的办学理念，以医学与工程学科的深度交叉融合为核心优势，构建“基础研究—临床转化—产业赋能”一体化的人才培养与科研体系。学院致力于培养具有国际视野、创新精神和复合能力的医工交叉人才，努力创建世界一流的生物医学工程学科，并建成我国在该领域创新人才培养和前沿科学研究的重要基地。

根据学科定位及专业特色，生物医学工程学院设置以下4个系：

神经工程系：该系致力于培养掌握神经工程、康复工程及信息工程等交叉学科基础理论和前沿技术的创新型复合人才，并开展神经功能康复理论及技术的研究。

医学影像与信息系：该系致力于培养掌握新型成像物理与方法、前沿成像技术、信息获取手段和健康信息数据处理方法的创新人才，并开展先进成像技术及设备研究。

生物电子系：该系致力于培养掌握生物电子融合材料、信息获取与分析等交叉学科前沿理论和技术的创新人才，并开展跨尺度生物信息探测器件及预防、诊断和治疗疾病的创新系统研究。

生物材料与组织工程系：该系致力于培养掌握结构和功能仿生生物材料构建基础理论和前沿技术的创新人才，并开展组织修复的生物材料工程技术及医学转化应用研究。