陈禹，研究员，博士生导师，国家级青年人才，国家重点研发计划青年项目首席科学家。2018年获得华东理工大学生物化工博士学位，后于瑞典Jens Nielsen实验室开展博士后研究，2023年加入中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所担任课题组长。发表SCI论文40余篇，其中代表性文章发表于Nature Protocols、PNAS、Trends in Biotechnology等期刊。
研究领域：
聚焦定量合成生物学领域，发展代谢网络建模方法，建立组学研究实验平台，整合“干”“湿”技术定量解析代谢调控机制，提高理性设计能力。
学习经历：
2012.09-2018.06，华东理工大学，生物化工，博士（硕博连读）
2008.09-2012.06，华中农业大学，生物工程，学士
工作经历：
2023.12-至今，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所，研究员
2023.02-2023.12，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所，副研究员
2018.02-2022.12，查尔姆斯理工大学，博士后
学术成就：
入选2025全球前2%顶尖科学家榜单；
担任Advanced Biotechnology期刊青年编委，PNAS、Trends in Biotechnology、Cell Systems等期刊审稿人；
担任中国生物信息学学会（筹）计算合成生物学专业委员会委员。
重大科技项目承担情况：
1. 国家自然科学基金面上项目，2026.01-2029.12，主持；
2. 国家重点研发计划“合成生物学”重点专项青年科学家项目，2024.12-2027.11，主持；
3. 国家高层次人才青年项目，2024.01-2026.12，主持；
4. 深圳市医学研究专项资金青年项目，2024.01-2026.12，主持；
5. 国家重点研发计划“合成生物学”重点专项项目，2023.12-2028.11，参与；
6. 深圳市科技重大专项项目，2024.01-2026.12，参与。
专利：
1. 一种基于单一基因组注释文件的多细胞过程模型构建方法及系统，CN121662180A，2026-03-13（发明人：陈禹，李永珠，黄家蔚）
1. Chen Y.#, Gustafsson J.#, Tafur Rangel A.#, Anton M., Domenzain I., Kittikunapong C., Li F., Yuan L., Nielsen J., Kerkhoven E.J.*, 2024. Reconstruction, simulation and analysis of enzyme-constrained metabolic models using GECKO Toolbox 3.0. Nat Protoc 19, 629–667.
2. Chen Y., Nielsen J.*, 2022. Yeast has evolved to minimize protein resource cost for synthesizing amino acids. Proc Natl Acad Sci U S A 119, e2114622119.
3. Chen Y., Nielsen J.*, 2021. In vitro turnover numbers do not reflect in vivo activities of yeast enzymes. Proc Natl Acad Sci U S A 118, e2108391118.
4. Chen Yu, Li F., Mao J., Chen Yun, Nielsen J.*, 2021. Yeast optimizes metal utilization based on metabolic network and enzyme kinetics. Proc Natl Acad Sci U S A 118, e2020154118.
5. Chen Y.#, van Pelt-KleinJan E.#, van Olst B., Douwenga S., Boeren S., Bachmann H., Molenaar D., Nielsen J.*, Teusink B.*, 2021. Proteome constraints reveal targets for improving microbial fitness in nutrient-rich environments. Mol Syst Biol 17, e10093.
